测序核心设备

ODU的MiSeq核心测序设备

ODU在我们的MiSeq核心设施内提供DNA测序.

bet8体育娱乐入口测序成本中心通过Illumina MiSeq™桌面测序平台提供下一代测序(NGS). 该测序仪允许对各种基因组样品进行高通量测序. 兼容的试剂盒允许靶向重测序,小基因组测序,RNA测序等. 读取长度从2x25到2x300,单端读取从1-25百万(配对端2-50M). 测序每次进行一个碱基,在每一步通过荧光检测终止子. 总运行时间取决于所使用的试剂盒,从不到一天到长达3天不等.

测序客户购买自己的耗材(库准备包), MiSeq包, PhiX, 生物分析仪芯片, 等). 服务费用见下文. 要订购服务,请填写这张表格. 然后,技术人员将与您联系,了解更多细节和顺序调度.

建议

  • 为您的特定样品研究最佳类型的库准备套件. Illumina科技服务对此非常了解,并且一直非常有帮助. 如果您不确定使用什么,我建议您联系他们.
  • 类似的, 如果NGS对你来说是新的, 在选择合适的MiSeq兼容试剂盒进行实际测序时,请咨询Illumina技术支持. 这取决于库的数量、样本长度、需要读取的次数等.
  • 适当和高质量的库准备是至关重要的. 在生物分析仪上检查样品的质量和大小,并在量子比特上进行量化,这是非常值得的. 准确的样本归一化是成功测序运行的必要条件.
  • 在汇集索引库之前,请确保它们被稀释到等摩尔浓度. 池库至少为10nM,并确保在冰箱中保留至少一半的10nM池库. 如果您出于任何原因希望重新运行您的样本,这将是重要的.
  • 所有的运行都需要一个PhiX的峰值. 这是一个积极的控制,它将允许我们确定运行是否正确地发生. PhiX改进了集群生成,并有助于排序和对齐. 在使用低多样性库时,这一点尤其必要. PhiX可以决定运行的成功与否.

强烈建议MiSeq客户利用Illumina提供的支持来确定哪些产品最适合每个客户的样品和研究目标. 有各种各样的产品可以满足不同的兴趣, 因此,了解您的需求并选择正确的选项是重要的,并简化了这些指南, 选择器和其他链接:

MiSeq测序器成本率表 

用户类型 MiSeq运行费用 技术人员的时间
内部 每次50美元 每小时30元
外部 每次100美元 每小时60元

 

运行费用

运行费用包括仪器的维护和服务费用.  用户将支付他们自己的测序消耗品的费用.e., MiSeq测序试剂盒,PhiX, BioAnalyzer芯片,KAPA定量试剂盒). 

技术人员的时间

技术人员的时间费用将根据每个请求报价.

与运行设置相关的技术员时间, 加载, 数据处理预计在2点左右完成.5小时(75美元).  质量控制分析可以通过MiSeq测序设备执行, 与生物分析仪相关的技术人员时间为2小时(60美元),KAPA定量为2小时.5小时(75美元).